Acetobacter cibinongensis
Le genre Acetobacter appartient au groupe des bactéries de l’acide acétique qui oxydent incomplètement les alcools ou les sucres, ce qui entraîne une accumulation de l’acide acétique. Les bactéries de l'acide acétique présentent un grand intérêt industriel en raison de leur utilisation pour la production de vinaigre à partir de spiritueux, de vin, de bière et de cidre dans les régions tempérées d'Europe, des Amériques et du Japon. Plusieurs espèces semblent être associées aux climats tropicaux.
Quarante-six souches de bactéries d'acide acétique récemment isolées à partir de fleurs, de fruits et d'aliments fermentés recueillies en Indonésie ont fait l'objet d'une étude taxonomique. C'étaient des bâtonnets à Gram négatif, produisaient de l'acide acétique à partir d'éthanol, d'acétate oxydé et de lactate en CO 2 et H 2 O, et avaient le système Q-9 comme principal système d'ubiquinone. Sur la base de la similarité ADN-ADN, toutes les souches étudiées, y compris les souches types et les souches de référence du genre Acetobacter, ont été séparées en onze groupes (groupes I à XI). Parmi les 46 isolats, deux ont été inclus dans le groupe II et identifiés comme étant Acetobacter pasteurianus, cinq dans le groupe IV comme A. orleanensis, 16 dans le groupe V comme A. lovaniensis, cinq dans le groupe VII comme étant A. indonesiensis et trois dans le groupe VIII. comme A. tropicalis. Les 15 isolats restants constituaient trois nouveaux groupes basés sur la similarité ADN-ADN; quatre isolats ont été inclus dans le groupe IX, deux dans le groupe X et neuf dans le groupe XI. Aucun isolat n'a été identifié comme étant A. aceti (groupe I), A. peroxydans (groupe III) et A. estunensis (groupe VI). L'analyse phylogénétique basée sur les séquences d'ADNr 16S de souches représentatives des groupes a indiqué appartenir aux souches du genre Acetobacter. Sur la base de la composition de base de l'ADN, de la similarité ADN-ADN et des séquences d'ADNr 16S, trois nouvelles espèces du genre Acetobacter sont proposées: Acetobacter syzygii sp. nov. pour le groupe IX, Acetobacter cibinongensis sp. nov. pour le groupe X et Acetobacter orientalis sp. nov. pour le groupe XI. La distribution des souches d’Acetobacter en Indonésie est examinée à la lumière des sources d’isolement.
