Acetobacter ghanensis
Vingt-trois bactéries d'acide acétique, isolées des fermentations en tas traditionnelles de fèves de cacao ghanéennes, ont été soumises à une étude taxonomique polyphasique. Les isolats étaient des bâtonnets Gram-négatifs à la catalase positive, à l'oxydase négative. Ils ont oxydé l'éthanol en acide acétique et ont été incapables de produire de l'acide 2-cétogluconique, de l'acide 5-cétogluconique et de l'acide 2,5-dicétogluconique à partir de glucose; par conséquent, ils ont été provisoirement identifiés comme étant des espèces Acetobacter. Le séquençage des gènes de l'ARNr 16S et l'analyse phylogénétique ont confirmé leur position dans le genre Acetobacter, Acetobacter syzygii et Acetobacter lovaniensis étant leurs plus proches voisins phylogénétiques. (GTG) (5) - Les empreintes digitales de PCR ont regroupé les souches dans une grappe ne contenant aucun type de souches de membres du genre Acetobacter. L'hybridation ADN-ADN avec les souches types de toutes les espèces reconnues d'Acetobacter a révélé des valeurs de parenté ADN-ADN inférieures au niveau de l'espèce. Les teneurs en ADN G + C de trois souches sélectionnées étaient de 56,9 à 57,3% en moles. Les nouvelles souches avaient des caractéristiques phénotypiques qui leur permettaient de se différencier des espèces d’Acetobacter apparentées phylogénétiquement, c’est-à-dire qu’elles étaient mobiles, ne produisaient pas d’acide 2-cétogluconique ni d’acide 5-cétogluconique à partir du glucose, étaient positives pour la catalase et négatives pour l’oxydase, sur la levure extrait avec 30% de glucose, poussé sur le glycérol (bien que faiblement) mais pas sur le maltose ou le méthanol comme source de carbone, et ne s'est pas développé avec de l'ammonium comme seule source d'azote et de l'éthanol comme source de carbone. Sur la base des données génotypiques et phénotypiques, les isolats représentent une nouvelle espèce du genre Acetobacter pour laquelle le nom Acetobacter ghanensis sp. nov. est proposé. La souche type est R-29337 (T) (= 430A (T) = LMG 23848 (T) = DSM 18895 (T)).
