Alternaria dauci

 Alternaria dauci est un phytopathogène. Le nom anglais de la maladie qu’il provoque est "carot leaf blight".

Brûlure des feuilles de la carotte

Brûlure des feuilles de la carotte

Hôtes et symptômes

Alternaria Leaf Blight est une maladie foliaire des carottes causée par le champignon Alternaria dauci. Alternaria dauci est inclus dans le groupe des espèces porri d’Alternaria, qui est classé pour sa grande conidie et son long bec filiforme. ^[ Comme beaucoup de membres de ce groupe ont une morphologie similaire, Alternaria dauci a également été classé dans les formes spéciales de carottes, ou A. porri f. sp. Dauci. Il est bien établi que la gamme d'hôtes de cette maladie concerne les carottes cultivées et sauvages, mais il a également été avancé qu'Alternaria dauci était capable d'infecter le panais, le céleri et le persil sauvages. Une étude réalisée en 2011 par Boedo et al. ont évalué la gamme d'hôtes d’Alternaria dauci dans un environnement contrôlé et ont conclu que plusieurs espèces autres que la carotte pouvaient constituer des hôtes alternatifs, telles que Ridolfia segetum (persil de maïs) et Caucalis tenet (persil de haie). En dépit de leurs conclusions, les rapports sur la colonisation d' A. Dauci sur des hôtes non carottes continuent à être débattus car l'utilisation des postulats de Koch sur les isolats d' A. Dauci récupérés est difficile et rarement signalée. de plus, peu de cas de telles infections sont souvent signalés sur le terrain.

Les symptômes de A. dauci apparaissent d'abord sous forme de lésions brun verdâtre, puis imbibées d'eau et enfin nécrotiques 8 à 10 jours après un événement infectieux.  Ces lésions apparaissent sur les folioles et les pétioles de la carotte et présentent un halo jaune chlorotique caractéristique. Les lésions peuvent être de forme irrégulière et apparaissent souvent en premier sur les feuilles les plus anciennes. Les feuilles les plus âgées sont les plus exposées à l'infection, quand environ 40% de la surface foliaire est infectée par Alternaria dauci, la feuille jaunit complètement, s'effondre et meurt. C'est pendant les longues périodes de temps chaud et humide que les lésions peuvent se rejoindre et causer la mort de la cime de plants de carottes, phénomène que l'on confond parfois avec le gel. Les symptômes de cette maladie sont également souvent confondus avec le mildiou des carottes ainsi que le mildiou bactérien. Des analyses microscopiques sont souvent nécessaires pour diagnostiquer avec précision l'agent pathogène. A. dauci produit des hyphes et des conidiophores allongés, de couleur foncée à brun olive, avec des conidies généralement portées seules. L’infection par le pétiole peut également se produire sans développement de lésion sur les folioles, et A. dauci peut en outre provoquer la fonte des semis, la brûlure de la tige des graines et des infections par inflorescence. Ces symptômes peuvent réduire considérablement le rendement en raison de la perte d'activité photosynthétique, de la prévention de la récolte mécanique et de l'infection des graines de carottes commerciales.

Cycle de maladie

Lésion d'Alternaria dauci

Une reproduction sexuée d’Alternaria dauci n'est pas connue  et la maladie est plus active pendant les cycles de culture du printemps, de l'été et de l'automne. Le cycle de la maladie commence lorsque le champignon hiverne sur ou dans la graine hôte et dans les débris de carotte provenant du sol. A. dauci peut également être disséminé dans les champs par des semences de carottes contaminées au cours de la culture. Une fois introduit, l'agent pathogène peut persister dans les débris de carotte ou les semences contaminées du sol pendant deux ans.  Une infection des plantules près de la jonction hypocotyle-racine (juste au-dessous de la limite du sol) survient alors au début du printemps après l'hivernage du mycélium ou des conidies d’Alternaria dauci. ^[ Cette région infectée deviendra nécrotique et conduira à la production d'un plus grand nombre de conidies asexuées sur les conidiophores, qui serviront d'inoculum secondaire. Le vent et la pluie provoquent la dispersion des conidies vers les espèces hôtes voisines, et de multiples tubes de germination seront produits à partir de chaque conidie qui colonisera avec succès un nouvel hôte. Au fur et à mesure de la pénétration, Alternaria dauci produira une substance chimique appelée phytotoxine, le zinniol, qui dégrade les membranes cellulaires et les chloroplastes, aboutissant finalement aux symptômes chlorotiques caractéristiques de la maladie. Ces tubes de germination vont percer les parois des cellules hôtes pour initier l'infection ou, si des plaies sont présentes, l'agent pathogène peut pénétrer de cette manière. Le processus de germination, de pénétration et de développement des symptômes se produit généralement dans un délai de 8 à 16 jours, mais la présence de plaies raccourcit le temps nécessaire pour mener à bien le processus.

À la suite de ces événements, des conidies sont produites de manière répétée à partir de lésions foliaires et souches tout au long de la saison estivale, permettant ainsi à l'agent pathogène d'être dispersé dans son environnement immédiat. L’inflorescence infectée par A. dauci au début de l’été produira des graines non viables, mais les plantes infectées plus tard en été ou au début de l’automne peuvent toujours porter des semences viables; ce champignon reste dans le péricarpe et ne pénètre pas dans l'embryon ni dans l'endosperme (non systémique). Après la récolte automnale, Alternaria dauci persistera dans les débris de carottes restants dans le sol ou sera concentré dans des semis infectés, et le cycle de la maladie sera répété.

Environnement

La production et la transmission d’Alternaria dauci augmentent lors de températures modérées à élevées et de périodes prolongées d'humidité des feuilles dues aux précipitations, à la rosée ou à l'irrigation par aspersion. L’infection peut survenir à des températures comprises entre 57 et 95 degrés Fahrenheit, 82 degrés Fahrenheit étant optimal. Le mycélium et les spores sont disséminés par les éclaboussures de pluie, les outils de culture ou les sols contaminés.  Les maladies à Alternaria, en général, ont tendance à infecter les tissus âgés, sénescents, et les plantes en développement sous stress. Une étude menée par Vital et al. en 1999, a évalué l’influence du taux de fertilisation du sol sur la gravité de la brûlure alternarienne des carottes et a découvert que de faibles niveaux d’azote et de potassium augmentaient la gravité de l’agent pathogène, tandis que des niveaux élevés de nutriments réduisaient la gravité de la maladie. Bien que cela ne soit pas bien compris, il est postulé que des niveaux d'azote plus élevés peuvent prolonger la vigueur d'une plante et retarder sa maturation, ce qui est important car A. dauci est plus susceptible d'infecter les tissus qui se déplacent.

Management

Une gestion efficace d’Alternaria dauci consiste à prévenir l'introduction et le développement de la maladie. L'une des meilleures pratiques pour éviter les infections consiste à planter des semences exemptes d'agents pathogènes ou traitées à l'eau chaude à 50 degrés Celsius pendant vingt minutes. En plus des semences traitées avec un fongicide ou de l’eau chaude, une fois la récolte terminée, il est impératif de retourner les résidus de carotte sous le sol. L'agent pathogène ne survit que sur les débris de plantes infectées, ce qui permet à cette pratique d'accélérer la décomposition des débris. La rotation des cultures laissera suffisamment de temps aux débris pour se décomposer. Les recommandations varient en fonction du lieu, mais 2 ans constituent l’indemnité minimale de rotation. La plantation continue de carottes dans le même champ entraînera une augmentation de l'infection. Les nouveaux champs ne doivent pas être situés à proximité de champs précédemment infectés afin d'éviter toute contamination par dispersion. La dispersion peut se produire de multiples façons, telles que les éclaboussures de pluie, le matériel agricole, les travailleurs et les insectes.

Les pratiques culturelles peuvent également promouvoir la réduction d’Alternaria dauci. Ils incluent des pratiques qui réduiront la durée d'humidité des feuilles et du sol. Il a été démontré que la plantation sur des plates-bandes surélevées avec un espacement plus grand des rangées réduisait l'humidité du sol, limitant ainsi la propagation de la maladie. Les symptômes ont tendance à être plus graves sur les carottes stressées ou mal fertilisées. Afin d'éviter des symptômes plus graves, veillez à ce que les plantes ne soient pas endommagées, arrosées et correctement fertilisées. Bien que des variétés résistantes ne soient pas disponibles, la sensibilité de la carotte diffère selon les variétés. Les variétés les moins susceptibles varient d'un État à l'autre et une liste de variétés adaptées à une région donnée peut être trouvée dans le programme d'extension de l'État. Dans le Midwest, l’Université du Wisconsin et l’Université du Michigan ont élevé des variétés telles qu’Atlantis, Beta III et Chancellor qui présentent une résistance.

En l’absence de semences traitées, il existe de nombreuses pulvérisations chimiques pour traiter Alternaria dauci. L'azoxystrobine, le chlorothalonil, l'iprodione, la pyraclostrobine et le bacille sont quelques-uns des fongicides courants à prendre en compte pour l'application foliaire. Parmi les marques à rechercher dans le Midwest figurent les RR Endura 70WG, Rovral et Switch. ^[17] L’acide giberrillique s’est révélé aussi efficace que les fongicides susmentionnés. Cependant, s’il est pulvérisé en excès, l’acide giberrillique peut retarder la transmission des nutriments des racines au feuillage, ce qui donne des carottes non développées. S'il s'agit de traiter chimiquement des plantes, il est de la plus haute importance de surveiller la culture. Les recommandations relatives au seuil initial varient en fonction de l'emplacement, de la période de l'année et du niveau d'humidité. Parmi les différentes recommandations, il convient de pulvériser dès l'apparition des premiers symptômes ou lorsque la maladie atteint 25% du feuillage.

Importance

Alternaria dauci est l'un des deux principaux agents pathogènes qui affectent les carottes dans le monde. La maladie se rencontre le plus souvent dans les climats tempérés en Amérique du Nord, aux Pays-Bas, au Moyen-Orient et même dans certaines régions de l'Asie du Sud et de l'Inde. La brûlure des feuilles de carotte est particulièrement dommageable en ce que ses lésions foliaires réduisent non seulement la surface photosynthétique, mais affaiblissent également les feuilles et les pétioles structurellement. Cela rend la récolte mécanique de la carotte moins efficace, et les rendements sont encore pires lorsque les feuilles brûlées ont été exposées à de fortes gelées.

Alternaria dauci peut se propager rapidement s'il n'est pas contrôlé. Entre février et novembre 2003, lorsque la maladie s'est propagée pour la première fois en Turquie, 73 à 85% des champs enquêtés se sont révélés infectés. Parmi ces champs, les taux de maladie parmi les plantes individuelles allaient de 65 à 90% des infections totales dans le champ. Les taux d'occurrence les plus élevés ont toujours été observés dans des champs humides peu drainés.

Pathogenèse

Alternaria dauci est surtout connu pour ses lésions foncées caractéristiques sur les feuilles des carottes. Ces lésions se retrouvent le plus souvent sur des feuilles matures, souvent suivies d'une nécrose complète. Les plus jeunes feuilles restent, pour la plupart, relativement indemnes. Immédiatement après la formation des lésions sur les feuilles, une chlorose commence à se produire. Une phytotoxine en particulier, la toxine Al, a été démontrée à la fois pour réduire la production de chlorophylle dans les feuilles et pour provoquer un retard de croissance.

Alternaria dauci infecte d'abord ses hôtes en utilisant des tubes germinatifs pour pénétrer dans l'épiderme de la cellule hôte. Pour ce faire, on utilise la phytotoxine zinniol, qui est la première toxine produite lorsque les conidies Alternaria germent dans l’eau. Zinniol est très hydrophobe et a été détecté à l'intérieur des parois cellulaires après l'apparition de l'infection. On suppose donc que la toxine dégrade la cellulose au-delà de la couche épidermique. Ensuite, on constate la désintégration des parois cellulaires voisines, ainsi que la dégradation de la structure cytoplasmique et la destruction complète des chloroplastes. Ceci est suivi par une nette diminution de la disponibilité des micronutriments polyphénoliques. Les polyphénols sont des régulateurs de croissance et de photosynthèse importants. Après seulement six jours d'infection, les feuilles inoculées ont presque totalement perdu leur photosynthèse.