Synthèse: Helminthosporium

Dans les zones de climat subtropical humide, prédominant dans les régions de culture de tournesol au Brésil, Alternaria est l’une des principales maladies qui sévit dans pratiquement toutes les régions et à toutes les saisons de semis. Les dommages causés par la maladie peuvent être attribués à la diminution de la zone photosynthétique de la plante, due à la formation de taches sur les feuilles et à la défoliation précoce. Les plantes gravement attaquées montrent une maturation précoce, avec une diminution de la production de graines et du poids.

Les symptômes Les symptômes initiaux typiques sur les feuilles sont de petits scores nécrotiques d'environ 3 à 5 mm de diamètre, de couleur brune à noire, arrondis à angulaires, avec halo chlorotique. Les lésions caractéristiques ont des cercles concentriques, semblables à une cible. Ces lésions peuvent fusionner en formant de grandes zones de tissu nécrotique, provoquant une défoliation précoce des plantes. Les symptômes se manifestent d'abord dans les feuilles inférieures, puis se propagent dans toute la plante. Cependant, une infection généralisée des feuilles peut survenir quelle que soit sa position dans la plante. Dans la tige et les pétioles, les lésions commencent par petites pointes ou rayures et, quand elles sont nombreuses, elles forment de grandes zones nécrotiques pouvant prendre toute la tige. En cas d'attaque sévère, la maladie provoque une croûte totale et, finalement, mort de la plante. La rupture des tiges est également fréquente. Dans les plantules, le champignon peut provoquer une brûlure des tissus en développement. Le champignon colonise également les bractées et le réceptacle floral, et peut même causer la pourriture du chapitre.

Étiologie - Les conidies de A. helianthi, de forme et de couleur cylindriques à ellipsoïdales, sont dépourvues de queue et formées séparément en conidiophores cylindriques et solitaires. En moyenne, ils ont cinq septa transversaux et une dimension de 74 x 19 µm. Les segments longitudinaux sont moins fréquents dans les conidies formées dans l'hôte que dans celles produites dans un milieu de culture. Le mycélium est brun olive, septé, lisse, ramifié et colonise les espaces intercellulaires des cellules mésophylle. Le champignon se développe lentement bien sporulé au milieu de la gélose pomme de terre-dextrose, formant des colonies grisâtres.

Les conditions optimales pour la germination des conidies sont une humidité relative élevée et une température comprise entre 25 ° C et 30 ° C. Dans des conditions favorables, le champignon produit une grande quantité de conidies et, en peu de temps, peut se propager à d’autres parties de la plante ou à d’autres plantes. La maladie se propage par le transport de conidies par le vent et la pluie. Le champignon infecte les graines et peut rester viable pendant de nombreuses années. L'agent pathogène survit également dans les résidus de récolte. Les tournesols sont sensibles à tous les stades de développement.

Agent pathogène

 Le tournesol (Helianthus annus L.) est une culture d'importance pour la production de pétrole, la consommation humaine des graines et comme fleur ornementale. La maladie du mildiou, également appelée tache des feuilles du tournesol, constitue une menace majeure pour cette culture. La maladie est causée par le champignon Alternaria helianthi(Hansf) Tubaki & Nishih. Des pertes de rendement allant jusqu'à 80% ont été signalées. La maladie est plus grave dans les climats chauds et humides (2). L'hôte principal est le tournesol, mais il s'est révélé capable d'infecter le carthame (Charthamus tinctorius ), la bavure de Noogoora ( Xanthium pungens ), le cocklebur ( Xanthium strumarium ) et la bavure de Bathurst ( Xanthium spinosum ) (3), qui peuvent tous servir d'alternative hôtes.

Alternaria helianthi est un ascomycète de la famille des pléosporacées. La plupart des membres du genre Alternaria n'ont pas de stade sexuel. Pour cette raison, ils ont été classés comme deutéromycètes (c.-à-d. Champignons imparfaits) dans la famille des Dematiaceae. Alternaria helianthi produit des conidiophores simples, rarement ramifiés, portant des conidies solitaires. Les conidies sont ellypsoïdes ou largement ovoïdes, de couleur brun clair et forment rarement des septa longitudinaux. 

Symptômes et signes

Les symptômes commencent avec des taches chlorotiques sur les feuilles qui deviennent ensuite brun foncé avec une taille et une forme irrégulières. Certains peuvent montrer un halo jaune autour de la tache. Sur les tiges, les lésions sont sombres et allongées. Les tiges gravement touchées finissent par se casser. Des lésions apparaissent également sur les pétales, les sépales et la tête. L'infection provoque la brûlure et la défoliation, la destruction des fleurs et une sénescence précoce.

Lorsque les conidies sont transmises par les semences, cela peut avoir un effet néfaste sur la germination des graines et provoquer la brûlure des plantules. Les conidies peuvent également être transportées par le vent et l’eau. Les températures favorables au développement de la tache des feuilles de tournesol sont comprises entre 24 et 27 ° C (1). En alternant des périodes d'humidité élevée avec des périodes sèches, le champignon sporule à profusion. Les conidies germent en produisant un ou plusieurs tubes germinatifs qui se propagent à la surface. Ils pénètrent dans l'hôte par le biais d'apressoria, de blessures naturelles et de stomates. Les conidiophores émergent par les stomates, les trichomes et le tissu vasculaire (3). Les conidies produites à ce stade vont provoquer des infections secondaires et se propager à des plantes saines. La principale source d'inoculum provient du mycélium et des conidies hivernant sur des débris végétaux.

Alternaria helianthi est un important champignon pathogène transmis par les semences, responsable de la maladie du mildiou chez le tournesol. Les méthodes de détection actuelles, basées sur la culture et l'identification morphologique, prennent du temps, sont laborieuses et ne sont pas toujours fiables. Une méthode de diagnostic basée sur la PCR a été développée avec des amorces spécifiques à une espèce conçues sur la base des données de séquence d’une région constituée du gène de l’ARN 5.8S et des espaceurs internes transcrits-ITS 1 et ITS 2 de séquences répétées du gène de l’ARN ribosomal nucléaire (ADNr) de r Helianthi La spécificité des paires d'amorces conçues par AhN1F et AhN1R a été vérifiée par analyse PCR de l'ADN de 18 souches d'Alternaria helianthi isolées d'Inde, 14 espèces non ciblées d'Alternaria. et 11 isolats fongiques d'autres genres. Un seul produit d'amplification de 357 pb a été détecté à partir de l'ADN des isolats d'A. Helianthi. Aucune réaction croisée n'a été observée avec aucun des autres isolats testés. La limite de détection de la méthode PCR était de 10 pg à partir de l'ADN matrice. Les amorces pourraient également détecter l'agent pathogène dans les graines de tournesol infectées. Cette méthode de PCR spécifique à l'espèce offre une alternative rapide, simple, puissante et fiable aux méthodes classiques de détection et d'identification de A. helianthi. Ceci est le premier rapport d'un ensemble d'amorces spécifiques à A. helianthi.

 La gestion

Les pratiques de lutte culturale comprennent: 1) la destruction de résidus végétaux pour éliminer la source d'inoculum; 2) la rotation des cultures avec des cultures non Asteraceae; et 3) en tenant compte des périodes de jachère. De plus, il est fortement recommandé d’ajuster le temps de semis afin qu’il ne coïncide pas avec la saison des pluies, la solarisation du pétrole et l’assainissement des champs afin de réduire les infections par Alternaria.

Le contrôle chimique n'est généralement pas nécessaire dans les zones à faible taux d'humidité. Dans les zones où la maladie est la plus grave, l'application de fongicides tels que le mancozèbe (0,2%), le chlorothalonil (0,2%), le difénaconazole (0,1%) ou le tébuconazole (0,1%) s'est révélée efficace. Pour obtenir les meilleurs résultats, une combinaison de contrôle culturel et chimique doit être mise en œuvre. Consultez votre spécialiste en vulgarisation local pour connaître les produits fongicides légaux et efficaces disponibles dans votre état. N'oubliez pas que l'étiquette est la loi et que l'applicateur du produit est responsable de la lecture et du suivi de tous les étiquetages de produits chimiques.

Procédures de diagnostic

Les méthodes traditionnelles de détection de la maladie comprennent l’insertion visuelle de plantes sur le terrain et l’incubation de semences pour évaluer les caractéristiques des colonies. Ces méthodes ont une valeur limitée car les infections par d'autres agents pathogènes (par exemple, Macrophomina phaseolina, Diaporthe helianthi) provoquent des symptômes similaires. De plus, d'autres espèces d’Alternaria sont fréquemment associées aux graines, ce qui rend difficile l'identification d’A. Helianthi .Les méthodes de détection moléculaire basées sur la PCR se sont révélées sensibles et précises pour une identification correcte, mais aucune méthode normalisée n'est encore disponible.

Un essai en serre visant à dépister la résistance du Alterna helianthi au tournesol est décrit. Une comparaison des conditions a conduit à la recommandation des conditions standards suivantes. Les premières ou deuxièmes paires de feuilles de jeunes plants au stade de croissance V8 sont inoculées à l'aide d'un inoculum cultivé sur de la gélose à l'extrait de feuilles de tournesol pendant 5 à 10 jours à une densité d'inoculum de 1 à 2 spores cm2 de tissu foliaire. Une période de rosée de 48 heures devrait être appliquée aux plantes couvertes par une tente en plastique. Une température de la période de rosée de 26/26 ° C nuit / jour et une température après la rosée par rapport à celle des conditions de croissance locales doivent être appliquées. Les lésions sont mesurées 7 jours après l'inoculation et la taille moyenne des lésions par plante est calculée. La taille moyenne des lésions des lignées testées est exprimée en proportion de la taille moyenne des lésions d'un standard sensible inclus dans chaque expérience de dépistage.