Colletotrichum gloeosporioides

Hôtes

Colletotrichum gloeosporioides est connu pour infecter une grande variété d'hôtes. Cependant, ce résumé traite spécifiquement de ses effets sur la papaye. Des informations sur la gamme d'hôtes de ce champignon peuvent être trouvées dans d'autres résumés sur cet organisme.

Distribution

Cosmopolite.

Symptômes

Cette maladie est régulièrement observée dans les champs avec des fruits mûrs ou trop mûrs. Les fruits non réfrigérés vendus sur les marchés locaux ne posent pas de problème grave. C'est le plus important pour les fruits qui sont réfrigérés et exportés vers les marchés étrangers.

Les premiers symptômes de l'anthracnose de la papaye sont des taches rondes, maculées d'eau et enfoncées sur le corps du fruit en mûrissement. Les lésions peuvent atteindre 5 cm de diamètre. Les zones orange rosâtre sont formées par les masses conidiales qui recouvrent le centre de la lésion et sont fréquemment produites dans un [motif en anneau concentrique].

Les symptômes peuvent également apparaître sous forme de taches irrégulières ou circulaires de 1 à 10 mm de diamètre, bien définies, parfois légèrement déprimées et de couleur brun rougeâtre. Ces lésions sont appelées "taches de chocolat". À mesure que le fruit mûrit, ces taches s’agrandissent rapidement (jusqu’à 20 mm de diamètre) pour former les lésions creuses circulaires caractéristiques.

Colletotrichum gloeosporioides provoque également de l'anthracnose sur les feuilles de papaye.

La biologie

Colletotrichum gloeosporioides Penz. un parasite facultatif appartient à l'ordre Mélanconiales. Le champignon produit des conidies hyalines, unicellulaires, ovoïdes à oblongues, légèrement incurvées ou en forme d’haltères, d’une longueur de 10 à 15 µm et d’une largeur de 5 à 7 µm. Les masses de conidies apparaissent en rose ou en saumon. Les acervules cireux, produits dans les tissus infectés, sont sous-épidermiques, généralement avec des soies, et de conidiophores simples, courts et dressés.

Les isolements des deux types de lésions différents ont pour résultat que les isolats de C. gloeosporioides sont indiscernables culturellement. Chaque isolat est capable de produire les deux types de lésions différents. Les facteurs impliqués dans l'influence d'un seul isolat pour produire ces différents types de lésions ne sont pas connus.

Les pétioles des papayes soutiennent le développement abondant de C. gloeosporioides et son stade parfait, Glomerella cingulata. Cependant, les isolats de pétioles, lorsqu'ils sont utilisés pour l'inoculation de fruits, ne provoquent pas l'anthracnose typique, la tache chocolatée, ni les lésions dépressives grises. En outre, ils ne produisent pas sur l’agar au jus V-8 les masses de conidies rose orangé caractéristiques des isolats de fruits.

L'agent pathogène infecte initialement des fruits verts immatures intacts et non blessés dans le champ. Les spores germent et forment des appressorias à la surface du fruit. Le champignon, utilisant son appressorium, pénètre de manière enzymatique dans la cuticule puis reste sous forme d'hyphes sous-cuticulaires jusqu'à ce que le stade post-climatérique de la croissance du fruit soit atteint. À ce stade, pour des raisons qui ne sont pas comprises, le champignon reprend sa croissance et provoque les symptômes caractéristiques. Ainsi, l'anthracnose de papaye a un stade de développement latent semblable à de nombreuses autres maladies liées à l'anthracnose des fruits tropicaux.

Les conditions environnementales favorisant l'agent pathogène sont les suivantes: températures élevées, 28 ° C optimales et taux d'humidité élevé. Les spores doivent avoir de l'eau libre pour germer; la germination est négligeable en dessous de 97% d'humidité relative. Les spores ne sont libérées d’acervuli que lorsque l’humidité est abondante. Les éclaboussures de pluie sont un moyen de propagation courant. La gravité de la maladie est liée aux conditions météorologiques et le champignon est relativement inactif par temps sec. La lumière du soleil, une faible humidité et des températures extrêmes (inférieures à 18 ° C ou supérieures à 25 ° C) inactivent rapidement les spores.

Épidémiologie

L'inoculum primaire peut être disséminé par le vent ou la pluie.

Contrôle non chimique

L'eau chaude à une température de 48 ° C pendant 20 minutes est un traitement efficace pour réduire l'incidence de l'anthracnose. Bien que les bains d’eau chaude n’éliminent pas complètement l’anthracnose, la réduction de la maladie est importante sur le plan économique.

Contrôle chimique

Les pulvérisations dans les vergers appliquées à intervalles de 14 à 28 jours, en fonction des précipitations, avec un fongicide de protection approprié sont généralement recommandées. Bien qu'aucun cultivar connu de papaye n'offre une résistance totale à l'anthracnose, le cultivar hawaïen Sunrise Solo est plus résistant que Kapoho Solo.

Les fongicides après récolte, appliqués en pulvérisation ou par immersion, avec une cire de qualité alimentaire se sont également révélés efficaces pour réduire l'anthracnose. C'est une pratique courante, en particulier pour les fruits expédiés vers les marchés étrangers.

Colletotrichum gloeosporioides a été signalé comme l’un des agents pathogènes les plus importants au monde, qui infecte au moins 1 000 espèces de plantes. La pourriture des fruits (anthracnose) est souvent attribuée à C. gloeosporioides et, dans une moindre mesure, à C. acutatum. Ces résultats antérieurs étaient toutefois basés sur une identification morphologique ou, si des données sur la séquence des gènes étaient utilisées, des comparaisons étaient souvent faites avec des noms mal appliqués. Colletotrichum gloeosporioides a récemment été épitypifié, de sorte que les cultures vivantes et les données de séquence sont, pour la première fois, disponibles pour la comparaison avec des collections fraîches. L'analyse des données de séquence de 25 isolats de huit fruits tropicaux est comparée à l'épitype de C. gloeosporioides. Contrairement à ce que l'on pouvait croire, aucun des 25 isolats de Colletotrichum issus de fruits tropicaux n'était C. gloeosporioides. Les cinq régions géniques utilisées dans cette étude ont permis de distinguer Colletotrichum asianum, C. fructicola, C. horii, C. kahawae et C. gloeosporioides dans le complexe «gloeosporioides» en tant que lignées phylogénétiques distinctes avec un support statistique élevé. Certaines autres nouvelles espèces probables du complexe «gloeosporioides» et de C. siamense n'ont toutefois reçu qu'un soutien modéré ou faible et des études supplémentaires sont nécessaires pour clarifier leurs affinités phylogénétiques et leurs placements taxonomiques. Les caractères culturels, conidiaux et appressoriels peuvent être utilisés pour différencier les taxons en complexes d'espèces, mais ne peuvent pas séparer des espèces au sein d'un complexe. Cette découverte aura des impacts importants sur de nombreux aspects de la pathologie des plantes, du diagnostic des agents pathogènes, des décisions en quarantaine, de la sélection des plantes, de la gestion et du contrôle des maladies des plantes, et ces points sont discutées.

Colletotrichum gloeosporioides est une espèce de champignons ascomycètes (syn. Gleosporium olivarum). Il est l'agent de la maladie de l'anthracnose qui touche en particulier les tomates et les olives. Il appartient au genre Colletotrichum dans la famille des Glomerellaceae. Le stade sexué (téléomorphe) correspondant est Glomerella cingulata. Les espèces du genre Colletotrichum sont parmi les principaux agents pathogènes des plantes, dans le monde entier.

Colletotrichum gloeosporioides

Olive picholine touchée par l'anthracnose : Claret (Hérault)

Nom binominal

Colletotrichum gloeosporioides
(Penz.) Penz. & Sacc., 1884

Caractéristiques

Le genre Colletotrichum se caractérise par la formation de structures appelées acervules en forme de disques aplatis, subépidermiques, avec des épines, les conidiophores simples et allongés, avec des conidies hyalines, unicellulaires, généralement en forme de bâtonnets, qui permettent aux acervules agrégées par une masse de polysaccharides solubles dans l'eau. Malgré le fait que ces spores ne sont pas des structures de résistance, les mycéliums du champignon peuvent subsister vivants pendant une logue période de temps, dans les semences, les débris culturaux ou en infections latentes dans les fruits.

Le champignon a une croissance rapide en milieu de culture Potato Dextrose Agar (PDA), formant des colonies concentriques de couleur vert-olive à marron, pouvant former ou non des secteurs.

Sous-espèces

• f. sp. aeschynomenes - J.T. Daniel, G.E. Tempelton, R.J. Sm. & W.T. Fox, 1973
• f. sp. alatae- R.D.Singh, Prasad & R.L.Mathur 1966;
• f. sp. clidemiae - E.E. Trujillo, Latterell & A.E. Rossi, 1986
• f. sp. cucurbitae - Menten, Kimati & C.P. Costa, 1980
• f. sp. cuscutae - T.Y. Zhang, 1985
• f. sp. heveae - (Petch) Saccas, 1959
• f. sp. hyperici
• f. sp. jussiaeae
• f. sp. miconiae
• f. sp. minihotis - Chevaug., 1956
• f. sp. melongenae - Fournet 1973
• f. sp. nectrioides - Gonz. Frag.
• f. sp. pilosae - U.P. Singh, 1974
• f. sp. salsolae - Berner, Bruckart, Cavin e J.L. Michael, M.L. Carter & Luster, 2009
• f. sp. stylosanthis
• f. sp. uredinicola - U.P. Singh, 1975

Variétés

• var. aleuritidis - Saccas & Drouillon, 1951
• var. cephalosporioides - (A.S. Costa) Follin & Mangano, 1983
• var. gomphrenae Perera 1965
• var. hederae - Pass. 1889
• var. minus - J.H.Simmonds 1968
• var. nectrioidea

Dommages aux cultures

Olives picholines le 23/10/2014 à Claret, l'une d'elles présente l'attaque par le sommet de la drupe (en bas)

Sous l'appellation d'anthracnose, on trouve une grande variété de fruits tropicaux atteints :

• mangues,
• papayes,
• caféiers,
• …

Ainsi que d'autres plantes (avocats, passiflores, annone, cacao, lime. Sous des latitudes plus nordiques fraises, pêches, etc. Des légumes sont touchés comme les piments et les tomates. Les pertes économiques sont importantes.

Lèpre de l'olive

Olives picholines et feuilles touchées par l'anthracnose (Colletotrichum sp.) à Claret (Hérault, France)

Le champignon est l'agent de la Lèpre de l'Olive. La maladie affecte les feuilles et les olives. Le champignon pénètre dans la plante par les ouvertures naturelles (lenticelles, stomates) ou les microblessures causées par les pontes de la mouche de l'olive (vecteur occasionnel). La température qui favorise l'infection va de 16 à 25 °C, avec un optimum de 22-24. Le chlorose initiée au printemps peut devenir uniforme pendant l'été. La maladie se manifeste à l'automne lors de l'invasion des fruits. L'infection est favorisée par l'humidité, spécialement surprenante et abondante dans la période végétative, particulièrement au printemps.

Les feuilles présentent des taches blanchâtres et virent au brun en se desséchant. Sur les olives, la maladie se manifeste par des taches brun-noir (spécialement au point d'insertion du pédoncule avec une dépression légèrement enfoncée de couleur brun obscur qui s'étend progressivement à tout le fruit qui se momifie et peut tomber à terre. La plante subit une défoliation plus ou moins marquée et les olives touchées ne sont plus acceptables pour la trituration. L'huile ainsi produite est un produit dégradé, rosâtre et avec une acidité (10-15%). Les olives de table sont impropres à toute confiserie.

En Italie la pathologie causée aussi par Colletotrichum acutatum concerne les régions les plus méridionales.

En septembre 2014, une attaque sans précédent sur les olives, avec également Camarosporium dalmaticum a provoqué une catastrophe économique sans précédent, attribuée à tort à la cécidiomye.

Lutte contre le parasite

Deux modes de lutte sont possibles et complémentaires.

Prévention biologique

La prévention consiste à tailler et enlever les branches atteintes qui seront incinérées. Les olives momifiées seront récoltées et détruites dans des seaux contenant de la soude ou incinérées.

Prévention chimique

La lutte se fait par l'emploi de sels de cuivre sous forme de préparations diverses autorisées (bouillie bordelaise, ...).

• Remèdes de grand-père jardiniers : des anciens préconisaient de planter un fil de cuivre dans les pieds de tomates pour lutter contre l'anthracnose.

Agent pathogène

Colletotrichum gloeosporioides (Anthracnose) est l’un des agents pathogènes fongiques les plus répandus dans les plantes. Il provoque une pourriture amère dans de nombreuses cultures dans le monde, notamment les plantes vivaces dans les régions tropicales (3). Parmi les plantes hôtes importantes figurent les agrumes, l'igname, la papaye, l'avocat, le café, l'aubergine, le poivron et la tomate. Il produit une quantité substantielle de pertes avant et après récolte pour ces cultures dans le monde entier. Il agit comme un envahisseur secondaire des tissus blessés, mais peut également survivre en tant que saprophyte.

Symptômes et signes

Colletotrichum gloeosporioides produit une grande variété de symptômes en fonction de l’espèce hôte et du tissu infecté. Dans les fruits, les lésions noires ou brunes (par exemple, sur les gousses, la gale et les piqûres) sont courantes. L'infection sur l'inflorescence provoque une brûlure, une nécrose et des lésions avec des mouchetures et des traînées. Les feuilles infectées produisent des couleurs et des motifs anormaux avec des zones sombres, nécrotiques, angulaires ou irrégulières. Le dépérissement et la décoloration avec gommose et résinose se produisent sur les tiges infectées. Parfois, les chancres sont également vus dans la tige infectée. La sporulation fongique forme des acervuli, une structure rosâtre de la taille d'une tête d'épingle, lorsque l'humidité est élevée. Les acervules se forment de manière concentrique autour du tissu nécrotique. Les fructifications peuvent être vues comme des taches noires dans les tissus infectés.

Dans certains hôtes de cucurbitacées, des lésions plus pâles avec moins de nécrose sont observées. En général, la nécrose se propage et se transforme plus tard en mildiou chez l’igname et le thé. Dans les stylosanthes et le manioc, les lésions ont une forme elliptique et paraissent sombres et enfoncées.

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Taxonomie

Royaume:

Champignons

Phylum:

Ascomycota

Classe:

Sordariomycètes

Ordre:

Incertae sedis

Famille:

Glomerellaceae

Genre:

Colletotrichum

Espèce:

C. gloeosporioides

Sous-espèces:

C. gloeosporioides

Nom scientifique

Colletotrichum gloeosporioides 
(Penz.) Penz. & Sacc.

Téléomorphe

Glomerella cingulata 
(Stoneman) Spauld. & H. Schrenk 

Noms communs et maladies

Pourriture amère et anthracnose, anthracnose

Ecologie et Spread

Le champignon colonise principalement les tissus endommagés et sénescents et se développe souvent sous forme de saprophyte sur des tissus morts. Les courants d'air, les éclaboussures de pluie, l'irrigation par aspersion et la rosée abondante dispersent les spores sur de courtes distances. La déposition de spores sur les jeunes feuilles et les fruits est suivie d'une colonisation. Les spores sexuelles, bien que produites en moins grand nombre, sont en suspension dans l'air et contribuent donc à la propagation sur de longues distances. Lors de la germination, les spores peuvent former une structure de repos en dormance jusqu'à ce que des lésions ou des dommages se produisent dans le tissu hôte. Le déverdissage brise également cette dormance. L'éthylène stimule la colonisation fongique dans les fruits récoltés précocement. Les insectes, les résidus de cultures de semences infestés et l'hôte de mauvaise herbe latent contribuent également à la persistance de l'agent pathogène et à la propagation de la maladie. Une température élevée et une humidité élevée sont favorables à la croissance de l'agent pathogène. La germination des spores nécessite une humidité relative élevée. Uniquement lorsque la teneur en humidité est la plus élevée, les acervules sont capables de libérer des spores. Le champignon n'est pas actif par temps sec.

Distribution géographique

L'organisme est trouvé dans le monde entier.

La gestion

• Utilisez des semences certifiées exempts de maladie et des greffes saines.
• Élimination des plantes infectées et des fruits pourris correctement.
• Effectuer un désherbage régulier et une taille rapide des parties de la plante infectées.
• Traitez les graines dans de l'eau chaude si vous utilisez vos propres graines.
• Améliorer la circulation de l'air en assurant un espacement adéquat lors de la plantation.
• Plantez des variétés plus résistantes, comme le niveau de résistance (polygénique) contre Colletotrichum spp. existe dans de nombreuses variétés de cultures.
• Appliquer des fongicides au début de la floraison et après la récolte.
• Consultez votre spécialiste en vulgarisation local pour connaître les produits fongicides légaux et efficaces disponibles dans votre état. N'oubliez pas que l'étiquette est la loi et que l'applicateur du produit est responsable de la lecture et du suivi de tous les étiquetages de produits chimiques.

  Procédures de diagnostic

• Les fructifications apparaissent comme de minuscules taches noires dispersées.
• Des masses de spores roses sont visibles au centre d'un ancien point noirâtre.
• Conidies - unicellulaires (10-15 µm de long et 5-7 µm de large) hyalin, légèrement incurvées, ovoïdes à oblongues
• Acervuli-waxy et sous-épidermique à conidiophores simples
• Des méthodes moléculaires sont disponibles pour le diagnostic de la maladie (1, 2).

  Colletotrichum est l’un des principaux agents pathogènes des plantes causant l’anthracnose, une maladie des plantes affectant divers hôtes, des arbres aux herbes. Dans le présent article, nous avons étudié la taxonomie, la biologie et le pouvoir pathogène de Colletotrichum gloeosporioides et les descriptions taxonomiques basées sur les approches morphologiques, microscopiques et moléculaires réalisées en Inde sont également discutées en détail. La biologie de l'agent pathogène en ce qui concerne ses conditions de croissance et les symptômes détaillés de l'anthracnose sont présentés. La pathogénicité de C. gloeosporioides en tant que champignons phytopathogènes, saprophytes et endophytes a également été discutée. Les différentes plantes-hôtes, infectées par la maladie de l’anthracnose et causées principalement par C. gloeosporioides, sont examinées en détail depuis l’année 1918. Un aperçu du mode de vie de C. gloeosporioides, qui peut être endophytique, saprophyte ou pathogène, est également présenté. Les produits botaniques utilisés pour la gestion de l’anthracnose en Inde sont également décrits. Une brève note sur le statut du genre Colletotrichum au XXIe siècle en Inde est présentée. Il a été constaté qu'environ six espèces de Colletotrichum, à savoir C. gloeosporioides, C. capsici, C. falcatum, C. truncatum, C. sansevieria, C. acutatum et C. coccodes, seraient présentes en 2000-2011. Par conséquent, la présente analyse constituera un condensé utile pour les mycologues et phytopathologistes afin d'étudier la gamme d'hôtes des espèces de Colletotrichum en vue de l'identification de nouvelles maladies des plantes, et posera de nouvelles questions en recherche phytopathologique pour des études futures.

  Les espèces de Colletotrichum sont présentes dans les régions tropicales et subtropicales du monde. Mais Colletotrichum gloeosporioides est l'agent pathogène le plus important et appartient à l'ordre des Mélanconiales. Le génome complet de cet agent pathogène n'est pas encore séquencé, mais divers gènes impliqués dans la pathogenèse et la défense de l'hôte sont identifiés. La température optimale pour la croissance de cet agent pathogène est de 25-28 ° C et un pH de 5,8-6,5. Il est généralement inactif pendant la saison sèche, mais dans des conditions favorables, il provoque la maladie de l’anthracnose sur un grand nombre de cultures rentables parmi lesquelles l’anthracnose de mangue est importante en ce qui concerne les pertes causées par un agent pathogène. Tout d'abord, l'agent pathogène établit une interaction avec l'hôte en produisant un appressorium mélanisé, puis pénètre dans la cuticule de l'hôte. Après pénétration, il se forme des vésicules infectieuses et des hyphes primaires. Plus tard, des hyphes secondaires se sont développés et se sont propagés pour tuer la cellule hôte. Colletotrichum gloeosporioides suit le mode d’infection hémibiotrophique, où se produisent des phases biotrophes et nécrotropes. L'agent pathogène a provoqué des lésions sur les feuilles, les fruits et d'autres parties de la plante. Enfin, ces lésions s’obscurcissent et forment un anneau circulaire. Colletotrichum gloeosporioides est également connu pour infecter les humains, mais seuls quelques incidents de telles infections sont connus. Un certain nombre de gènes fongiques ont été identifiés à l'aide d'un criblage mutant, qui joue un rôle dans différentes phases de l'infection et peut être utilisé comme cible potentielle pour élaborer des stratégies de lutte contre l'anthracnose dans les champs. Cette revue se concentre sur la connaissance actualisée de tous les aspects de la biologie de C. gloeosporioides.