Elsinoë batatas

Elsinoë batatas est une espèce de champignon de la famille des Elsinoaceae . C’est un phytopathogène qui affecte les membres du genre Ipomoea, y compris la patate douce. , que l’espèce a été décrite initialement en 1931 comme une espèce de Sphaceloma et en 1943 a été transféré à Elsinoë par Ahmés Pinto Viegas et Anna Eliza Jenkins.

Généralités

• Maladie fongique mondialement répandue spécifique de la patate douce.
• Parfois attribuée à Sphaceloma batatas qui est en fait la forme asexuée du champignon (anamorphe).
• Symptômes affectant les feuilles jeunes et les tiges de la plante. 

• Famille(s) botanique(s) sensible(s) 

 La patate douce est le seul ôte connu

• Zones de production affectées :

• Organes attaqués

Symptômes

• Symptômes :
  • Apparition de petites lésions nécrotiques noires le long des nervures des feuilles et sur les jeunes tiges. Ces altérations s’allongent et prennent un aspect liégeux et une couleur souvent rouille le long des nervures des feuilles. Ces dernières montrent plus ou moins un développement bloqué et un aspect crispé.
  • Lésions comparables sur pétioles générant leur déformation localement.
  • Plages liégeuses sur tiges de teinte plutôt beige comme sur les pétioles.
  • Dans les cas de fortes attaques, les feuilles sont recroquevillées vers le haut, les tiges sont érigées.

Biologie

• Conservation : le champignon peut se maintenir sur les débris végétaux de culture. Ses autres modes de conservation sont encore mal connus.
• Infection : après germination, le champignon pénètre dans les tissus végétaux et produit des zones liégeuses.
• Sporulation : 
• Dissémination : naturellement, les spores produites par les lésions liégeuses sont dispersées par le vent et les éclaboussures de l’eau de pluie. De plus, la dissémination peut se faire par l’utilisation de boutures infectées
• Conditions favorables : présence d’eau libre sur les plantes (pluie ou rosée) favorisant la germination des spores.

Protection

• Utiliser des variétés tolérantes ou résistantes.
• Respecter le principe de rotation des cultures.
• Eviter de planter à proximité d’un champ ayant été fortement impacté.
• Utiliser des boutures saines ne présentant pas de symptôme de scab. La production de boutures en « seed-bed » permet d'améliorer la qualité sanitaire du matériel végétal produit.
• Effeuiller les boutures avant la plantation dans une zone de préparation éloignée du champ, pour limiter les risques de développement de la maladie en début de culture.
• Favoriser l’aération et l’ensoleillement de la culture (densité de plantation et choix de parcelle en fonction de son orientation).

Plantes hôtes / espèces affectées

Ipomoea batatas (patate douce)

Liste des symptômes / signes

Feuilles - couleurs anormales

Feuilles - formes anormales

Tiges - décoloration de l'écorce

Tiges - distorsion

Symptômes

Des lésions brunes petites, distinctes à confluentes, circulaires à elliptiques ou allongées se produisent sur les feuilles et les tiges; sur les feuilles, ils sont généralement hypophylles, communs le long de la nervure principale, des nervures et des pétioles, atteignant 2 mm de long; sur les nervures des feuilles, elles deviennent bouchées, provoquant un rétrécissement des nervures et un enroulement des feuilles (Clark et Moyer, 1988 ; Sivanesan et Hyde, 1992). Les lésions de la tige et du pétiole sont surélevées avec les centres bruns et les marges plus claires. Les lésions fusionnent pour former des croûtes; les tiges et les pétioles peuvent être tordus et déformés.

Prévention et contrôle

Les stratégies de lutte contre la maladie incluent des méthodes chimiques, sanitaires et de culture et l'utilisation de variétés résistantes. 
Résistance de la plante hôte 

La résistance est l'approche la plus pratique et la plus économique pour lutter contre la gale. Le matériel génétique et les lignées de sélection sont systématiquement examinés sur le terrain et sous serre, dans des zones où la tavelure est répandue et grave. Un dépistage sur le terrain de la résistance à la tavelure a été réalisé en Australie, aux Fidji, en Indonésie, en Papouasie-Nouvelle-Guinée, aux Philippines, aux Îles Salomon, en Thaïlande, aux Tonga et au Vanuatu (Gapasin, 1984 ; Goodbody, 1982 ; Jackson, 1988 ; Ramsey et al. 1988). ). 

L'inoculum naturel est généralement utilisé pour le dépistage sur le terrain. Aux Philippines, une variance génétique additive relativement élevée pour la classification de la gale et la teneur en matière sèche a suggéré que la résistance à la gale pourrait être améliorée par la sélection au sein de la population (Mariscal et Carpena, 1988). Par exemple, aux Tonga, un dépistage efficace a été réalisé avec des inoculum naturels et des rangées d'épandage sensibles. 

La collection de matériel génétique des hautes terres (environ 1 000 variétés) de la station de recherche de Kuk en Papouasie-Nouvelle-Guinée a été évaluée pour déterminer sa réaction sur le terrain à la gale utilisant un inoculum naturel dans des conditions propices au développement de la maladie (Lenné, 1991). Environ 60% des variétés étaient résistantes et 20% sévèrement touchées (P. Kokoa, Station de recherche Kuk, Mt Hagen, Papouasie-Nouvelle-Guinée, communication personnelle, 1990). 

La résistance du champ à la tavelure a été constatée dans des collections de matériel génétique et des lignées de reproduction en Asie du Sud-Est et dans le Pacifique. Des variétés résistantes ont été identifiées au Centre asiatique de recherche et de développement sur les légumes (AVRDC) à Taïwan et en Australie, aux Fidji, en Indonésie, en Papouasie-Nouvelle-Guinée, aux Philippines, aux Îles Salomon, aux Tonga et au Vanuatu (AVRDC, 1988, 1989, 1990; Bajit et Gapasin, 1987 ; Kanua et Floyd, 1988 ; Kumar et al. 1985 ; FAO, 1986 ; Ramsey et al. 1988). 

Un certain nombre de méthodes de dépistage de la résistance contrôlée ont été utilisées. Des techniques d'isolement, de multiplication et d'inoculation contre E. batatas (Sphaceloma batatas) ont été mises au point en Australie, à Taiwan (AVRDC), en Indonésie, aux Philippines, en Papouasie-Nouvelle-Guinée et aux Tonga (AVRDC, 1988, 1989, 1990; Lao et Divinagracia, 1979 ; Nayga et Gapasin, 1986 ; Paningbatan, 1987 ; Ramsey et al. 1988 ; Smit et al. 1991). 

Au Centre de recherche et de formation sur les plantes-racines philippines (PRCRTC) de Visca (Philippines), des germes et des parcelles de reproduction sont inoculés avec des spores de S. batatas plusieurs fois tôt le matin pendant la période de croissance afin de créer de graves épidémies et d'obtenir un meilleur dépistage. Le matériel génétique et la descendance issus du programme de sélection sont évalués sur le terrain à l'aide d'une échelle de 1 à 9. Les variétés résistantes sont sélectionnées pour les tests en serre. Les boutures sont cultivées pendant un mois et les tiges sont frottées avec du carborundum et lavées avec de l'eau distillée. L'inoculum est obtenu à partir de parcelles infectées. Cependant, la variabilité dans la qualité et l'âge de l'inoculum et / ou l'existence de races n'est pas prise en compte. Des morceaux de tige d'environ 3 cm de long sont collectés sur le terrain et maintenus à une température et à une humidité élevées pendant 24 heures pour stimuler la sporulation; ils sont ensuite collés sur des boutures à filtrer. Les plantes inoculées sont placées dans un Monsieur et évaluées après plusieurs jours. Seuls les isolats de Visca sont utilisés. Après un autre filtrage sur le terrain, les lignes résistantes sélectionnées sont à nouveau filtrées dans la serre. A ce stade, une évaluation plus détaillée des caractères morphologiques et de la résistance est réalisée. 

Des travaux préliminaires au PRCRTC ont permis d'identifier une variation pathogénique parmi huit isolats d'E. Batatas (S. batatas) obtenus lors de divers essais à Visca. Six différentiels ont été identifiés, y compris plusieurs lignes de Visca largement distribuées. Des boutures âgées de deux semaines ont été ensemencées avec 5 x 10 <4> spores / ml jusqu'à l'écoulement et des boutures inoculées ont été enfermées dans des sacs en plastique pendant 2 jours. Le développement de la gale, mesuré en densité de lésion relative, a été évalué pour les 30 premiers cm de boutures selon une échelle de 1 à 9. Bien que l’évaluation de la densité de lésion relative soit probablement trop subjective pour permettre une définition précise de la race, les résultats suggèrent les trois races différentes. En revanche, une étude comparative de 43 isolats de six pays différents sur 30 variétés de patates douces (Lenné et al. 1994) a révélé des différences considérables entre les isolats en ce qui concerne l'agressivité, mais rien n'indiquait une spécialisation pathogène. Il serait utile de poursuivre les travaux avec des isolats de différentes régions des Philippines et d’autres pays. 

À l’Institut de sélection végétale (IPB) de Los Baños, aux Philippines, des variétés prometteuses sont examinées pour détecter la réaction de la tavelure dans la serre. L'inoculum est cultivé dans une décoction de patates douces (préparée à partir de dessus de patates douces) pendant 2-3 semaines et agité quotidiennement. Des boutures âgées de trois semaines sont utilisées pour le criblage en serre. L'inoculum est pulvérisé jusqu'à l'écoulement et les plantes inoculées sont placées sous une humidité élevée et évaluées au bout de 5 jours. 

La gale de la patate douce fait l’objet d’une enquête en Indonésie depuis le milieu des années 1970.Le champignon a été isolé, cultivé artificiellement, multiplié et ensemencé avec succès dans des conditions sous serre (Mukelar, 1988 ; Anggiani et Mukelar, 1988, cité dans Lenné, 1991). Le champignon est isolé avec de la gélose pomme de terre-dextrose (PDA); la gélose à base de soja (SMA) est supérieure pour la multiplication des spores. Les colonies sont homogénéisées et étalées sur SMA. Deux boutures âgées d'une semaine sont utilisées dans des tests de pathogénicité. La sélection de la résistance en Indonésie pourrait être effectuée en serre, car les résultats des études d'inoculation en serre sont fortement corrélés à ceux obtenus sur le terrain. 

Des variations des caractères culturels et de la pigmentation en agar ont été observées parmi les isolats de différentes régions d'Indonésie, mais aucune comparaison de souche n'a été faite (A. Mukelar, BORIF, Bogor, Indonésie, communication personnelle, 1990). 

Une technique de dépistage rapide de la résistance à la tavelure chez les plantules a été mise au point à Tonga par Smit et al. (1991). Les épiphytotiques sont établies artificiellement sur des plantules utilisant l'inoculum de plantes cultivées au champ plutôt que l'inoculum cultivé, afin d'éviter toute perte de virulence, avant leur transplantation au champ. L'inoculum a été dérivé de plantes cultivées sur le terrain appartenant à différents cultivars en incubant des coupes de tiges et de pétioles de boutures fortement infectées dans des boîtes de Pétri pendant 2 jours. Une population de plantules inoculées avec une suspension de 3-4 x 10 <3> spores / ml a été divisée en trois groupes: gravement infecté (43%), moyennement infecté (36%) et non infecté (21%); 76% des clones issus de plantules non infectées et modérément infectées sont restés résistants lors d'essais au champ menés dans des épidémies naturelles. Parmi les clones issus de plants fortement infectés, 75% étaient sensibles au champ. 

Un certain nombre de techniques différentes d’isolement, de multiplication, d’inoculation et d’évaluation sont utilisées pour le dépistage en serre et sur le terrain de la résistance à la tavelure chez la patate douce. Cela rend difficile les comparaisons au sein des pays et des régions et entre ceux-ci et il serait utile de développer des méthodologies standard. 

La valeur de la résistance à la tavelure en dehors de l'endroit où elle a été sélectionnée est discutable. Les variétés AVRDC, résistantes à la gale à Taïwan, sont sensibles aux Philippines et les variétés PRCRTC de Visca sont sensibles dans d’autres régions des Philippines ( Lenné, 1991 ). Le Centro International de la Papa (CIP) a recommandé que les variétés résistantes de Tonga et de l'AVRDC soient nettoyées et distribuées dans toute l'Asie du Sud-Est et le Pacifique. Cependant, il conviendrait de rechercher davantage d'informations sur les variations pathogènes chez E. batatas (S. batatas) et sur les résultats d'essais de criblage multi-localisés de variétés sélectionnées avant que cela ne soit mis en œuvre, car rien n'indique que ce matériel résistera en dehors des sites lequel il a été sélectionné. 

Les bases de la résistance à la gale ont été peu prises en compte. Bajit et Gapasin (1987) ont noté que les variétés résistantes avaient des cuticules plus épaisses et moins de stomates. Des études sur la résistance à la gale pourraient aider à identifier le matériel génétique présentant un potentiel. 

Contrôle culturel 

Les méthodes sanitaires telles que la destruction des résidus de cultures infectées, la rotation avec d’autres cultures et la mise en jachère des champs s’appliquent facilement à la lutte contre les maladies dans les systèmes d’agriculture de subsistance. La sélection de matériel de plantation indemne de maladie est également relativement facile, à condition que le matériel soit suffisant, car les symptômes de la gale sont évidents chez les jeunes pousses. L'incidence de la maladie a été maintenue à un faible niveau à Java en sélectionnant du matériel de plantation propre et en utilisant la rotation des cultures (Lenné, 1991). 

Contrôle chimique 

En raison de la réglementation variable en matière de (dé) enregistrement des pesticides, nous ne présentons pour le moment aucune recommandation spécifique en matière de contrôle des produits chimiques. Pour plus d'informations, nous vous recommandons de consulter les ressources suivantes: 

• Base de données de l'UE sur les pesticides (www.ec.europa.eu/sanco_pesticides/public/index.cfm)
• Base de données PAN sur les pesticides (www.pesticideinfo.org)
• Votre guide national des pesticides

  Impact

  La tavelure des feuilles et des tiges est la maladie foliaire fongique la plus grave des patates douces en Asie du Sud-Est et dans le Pacifique. Aux Philippines, des pertes de rendement de 50% ont été mesurées sur le terrain (Divinagracia et Mailum, 1976). Dans des conditions contrôlées, l'inoculation de plants âgés de 2 à 4 semaines présentait une perte de rendement de 28%, tandis que ceux inoculés à 8 semaines ne présentaient qu'une perte de rendement de 4% (Gapasin, 1984). Une infection dans les deux à quatre semaines suivant la plantation entraîne une perte de tubercules commercialisable plus importante qu'une infection ultérieure (Nayga et Gapasin, 1986). 
  
  En Papouasie-Nouvelle-Guinée, la tavelure a réduit les rendements de patate douce de 57% (Goodbody, 1983), de 19% (rendement commercialisable de 34%) (Floyd, 1988) et de 27% (P. Kokoa, Station de recherche Kuk, Mt Hagen, Papouasie). Nouvelle Guinée, communication personnelle, 1990). Le nombre de tubercules était le paramètre de rendement le plus gravement touché. Une corrélation positive significative a été observée entre le rendement en racines commercialisables et le pourcentage de surface foliaire non touchée par la tavelure à Tonga (Stier et Van Wijmeersch, 1984, cité dans Lenné, 1991), tandis qu’en Australie, une corrélation négative a été démontrée entre le rendement et la croissance. La sévérité de la gale était significative 55 et 82 jours après le semis, mais pas plus tard (Ramsey et al. 1988).

  

•